朱由检淡然道：“狗？那是你叫的。现在，他是朕的刀。”整顿吏治，修税理政，辅以良乡新军之捷，三者如鼎三足，撑起了大明这个摇摇欲坠的帝国。而朱由检心中却更清楚，这才只是第一层外壳。整顿吏治、修税理政、新军初捷，大明朝堂似乎终于稳住了摇晃的根基。最后一环，便是军制。在朱由检的授意下，温体仁再度出手，不再止于朝堂条陈，而是将手伸进了军中这个积弊最深的旧泥潭。他与兵部尚书孙承宗密议三日，定下大政方针：全面清理卫所、整顿营伍、推行募兵、废除虚军、精简饷口，改养兵为用兵。明军旧制，以卫所屯军为骨干，然多年荒废，早已兵不识器、将不识兵。温体仁亲奏上疏：“卫所之弊，三百年来之痼疾。其名曰军，其实为丁；其饷入官，其兵不练。此非兵制，乃养冗也。”朱由检亲批：“从军者，不得不战；不战者，不得食饷。”随后兵部发出命令，各地督抚须在三月内，彻查辖内卫所实兵实丁，一经查出虚报、冒名、转籍者，连主将一并革除；军饷发放，须凭点名验兵、亲签军籍方可入账。这道命令一出，边军一时哗然，但地方清出“吃空饷”者竟多达四万人之巨，数年内节省饷银达百万两。在良乡“天雄军”成功的基础上，朱由检决定：募兵制，由试点，向全境推广。他亲口训令温体仁：“大明不缺人，缺的是能打仗的人。”于是，内阁下令开设武学募兵所于顺天、保定、开封、登州、南昌、成都六地，公开招募年满十六至三十之青壮，以军饷为引，以前途为利，先操后任。兵部则设新军编练处，由卢象升、曹变蛟等出任操典顾问，授新制鸳鸯阵、火器步操、夜战突袭等课程。募兵者需考操、训战、测胆，录取不过三成；但录者一律穿制式军装、领定饷、设晋升。有人讥讽：“皇上这是在玩西洋法。”朱由检却淡然回道：“若西洋法能胜我腐兵，我为何不用？”为避免募兵再沦为腐败泥潭，温体仁提议设兵饷巡核司，直属兵部，查督全国军粮军饷流转。军将不能支配饷银，只负责领兵操练、临战指挥；饷银由专人发放，军需由专库直送。此举等于将将权、饷权、兵源三者彻底分离。孙承宗最初颇有异议，上疏质疑：“军将无兵权，若战时号令不及，恐致贻误。”朱由检批示：“将之权在战，政之权在朝。用兵可权，养兵不可乱。”孙承宗虽无奈，但眼见新军数次演练调动迅捷、军纪森严，也只能叹服：“自成祖之后，朝廷再无此规模新制矣。”但朱由检知道，真正能让王朝长久的，不是几场捷报，也不是几道折子，而是一支真正能打仗的军队。他将目光投向了卢象升的天雄军。良乡一役大捷后，卢象升未曾返京，而是坚守营中，继续扩军操练。这支原本只有三千人的新军，在战后陆续补入战俘、募兵与各地调拨兵源，迅速扩编至五千人。